Window 10 October 2018 Update (билд 1809) еще не распространяется через Windows Update, но вполне может быть установлено принудительно с помощью Windows Media Creation Tool. И, как выяснилось, при неудачном стечении обстоятельств это обновление способно удалить файлы из пользовательского профиля. Предположительно пострадали системы с клиентом OneDrive, которые перенесли в него стандартные папки, и у которых не хватило места в облаке на их полный бэкап. Впрочем, есть и другие версии - например, о включенной групповой политике, отвечающей за удаление старых файлов при перезагрузке [ https://www.ghacks.net/2018/10/04/bugs-and-issues-of-windows-10-version-1809/ ].